Angew. Chem. | 固定在树脂上的异羟肟酸用于合成双靶HDAC抑制剂和PROTAC小分子

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分享一篇Angewandte上的文章,本文的通讯作者来自德国海因里希-海涅大学药物与药物化学研究所的Matthias U. Kassack教授和来自莱比锡大学医学院药物发现研究所的Finn K. Hansen教授。

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众所周知,组蛋白乙酰转移酶(HATs)和组蛋白脱乙酰酶(HDACs)是控制组蛋白和非组蛋白蛋白质乙酰化水平的关键酶。最近的临床前表明烷基化剂和HDAC抑制剂(HDACi)的组合通过增加HDACi介导的染色质对烷基化剂的DNA损伤,可对抗耐药性多形胶质母细胞瘤(GBM)显示出不错的功效。因此,有研究通过将DNA烷基化药物苯达莫司汀和HDACi 伏立诺他(SAHA)的药效团融合,开发出了小分子Tinostamustine,该小分子表现出优异的体内活性,这表明DNA / HDAC双靶向抑制剂可能是有望用于癌症治疗的药物。由于基于HDACi的多靶点药物在临床前和早期临床研究中显示出巨大的希望,迫切需要有效的合成方案,以允许合成具有链接或合并的药效团的化合物文库。


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本文中,作者开发了一种用于固相合成的预载树脂的方法——固定在树脂上的异羟肟酸(HAIRs)。为了证明这些HAIRs的实用性并利用HDACi和烷基化剂之间的协同作用,作者通过快速,直接的合成方法成功制备了一组具有DNA烷基化特性的HDACi。同时,作者还将HAIR的技术范围进一步扩展到了概念验证PROTAC的合成。


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首先,作者先将羟胺固定化来修饰市售的2-CTC树脂,之后将Fmoc保护的HDACi连接基加载到官能化树脂上,形成预加载的树脂HAIRs。建立预加载的树脂后,作者将DNA烷基化药物temozolomide (TMZ),mitozolomide (MTZ), andchlorambucil (CAB) 引入到帽基团区域。使用平行合成策略,作者制备了一系列化合物,将每个接头与每个烷基化剂结合在一起,产生了一个包含15个杂合分子的文库。这种方法提供的目标化合物的总收率高达83%。同时,对于每种抑制剂,仅需在合成的最后阶段进行一个纯化步骤即可实现快速,高效的文库扩展。之后,作者发现在这些化合物中包含肉桂基接头和CAB作为烷基化反应基团化合物3n是最有前途的化合物,3n既能够很好地抑制HDAC1和HDAC6的体外活性,又可以很好地抑制三种癌细胞系的抗增殖作用。同时,作者还通过γ-H2AX分析测试了3n对于DNA双链断裂的影响,证实3n确实能够引起Cal27细胞中γ-H2AX水平的最大增加,明显高于其他小分子。同时,作者通过分子对接的实验发现,在帽基的对位上掺入DNA-烷基化特征对HDAC抑制作用几乎没有影响,因此可以用于增强HDACi的抗癌作用。


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在成功地直接合成DNA烷基化HDACi化合物文库的鼓励下,作者将HAIRs方法扩展到PROTAC中,由于其高分子量和双功能性质,PROTAC小分子的合成通常很麻烦,涉及多步的合成过程。因此,作者进行了HDAC PROTAC小分子的首次固相合成,合成了HDAC PROTAC 4小分子,Fmoc脱保护和酰胺偶联的重复循环,可以实现模块化方式引入HDAC反应基团,PROTAC连接基团和基于泛素E3连接酶配体沙利度胺。作者的实验结果表明,HDAC PROTAC 4是一种有效的HDAC降解分子。使用AML细胞系HL60进行的蛋白质印迹实验证实,HDAC PROTAC4能够以浓度依赖性方式降解HDAC6和HDAC1。此外,用HDAC PROTAC4处理HL60细胞能够导致组蛋白H3(降低了HDAC1-3活性的标记)和α-微管蛋白(降低了HDAC6活性的标记)的显著超乙酰化作用。
总之,本文作者已经开发了一种有效的固相合成方案,使用固定在树脂(HAIRs)上的异羟肟酸制备新型的双靶表观遗传细胞毒性化合物。可以实现对于HDAC6抑制剂和DNA烷化剂的双功能分子,并且成功实现HDAC PROTAC小分子的首次固相合成。



本文作者:LSC

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/anie.202006725

原文引用:10.1002/anie.202006725

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