分享一篇近期发表在J. Am. Chem. Soc.上的文章,题为Native Peptide Cyclization, Sequential Chemoselective Amidation in Water。文章的通讯作者是来自纽约州立大学的张强教授。
多肽和蛋白质作为治疗药物和生物化学工具具有十分重要的意义。尽管多肽合成方法取得了重大进展,但是选择性修饰不同氨基酸侧链和末端仍然面临挑战,通过分子间或分子内方法直接将未受保护的线性多肽进行连接在化学上还是无法实现(图1a)。本文中,作者介绍了一种天然多肽环化(NPC)方法,这种方法可以通过顺序化学选择性活化实现分子内多肽连接,并且无需末端基团预修饰或侧链保护。
作者认为,将C端作为主要的亲核残基是实现NPC的化学选择性的关键。在中性至较高pH(7−12)时,Cys巯基负离子的亲核性比其他残基更强。而在低pH(2−5)时,羧酸根离子表现出最强的亲核性。基于以上亲核性的比较,他们设想在pH ~ 3的条件下多肽中亲核性最强的C端会优先与亲电活化剂(异腈)结合形成混合酸酐。活化的C端基团随后通过N端Cys巯基的分子内硫解形成硫内酯,最后经过动力学控制的N-S转换形成稳定的酰胺键,从而实现多肽的环化(图1b)。
首先,作者选择五肽Cys-Trp-Asn-Tyr-Ala(CWNYA)进行初步的化学选择性NPC研究(图1c)。在38 °C的PBS(pH = 7.8)中用异丙基异腈处理CWNYA,导致N端全部形成CWNYA-N-甲酰基酰胺。降低PBS的pH会同时生成环状CWNYA和CWNYA-N-甲酰基酰胺,且环状CWNYA的收率有所提高,表明pH对环化的选择性有明显影响。作者尝试用NaOAc/HOAc和NaH2PO4/H3PO4将反应pH降低到4以下,但难以得到环化产物。最后他们将线性多肽CWNYA的TFA盐溶解在纯水中,从而获得最佳结果(73%的环状CWNYA)。此外,他们发现室温下水溶液中的反应形成了硫内酯,验证了作者所提出的硫解过程。
接下来作者研究了NPC对35种未修饰多肽的环化的选择性和兼容性(图2)。这种方法表现出优异的兼容性,有效地实现了各种多肽的环化,其中最长的环肽含有20个残基,显示了NPC在合成大环多肽方面的潜力。由于保留残基的手性中心是有效连接的关键,作者研究了NPC诱导差向异构化的倾向。他们制备了五对线性多肽序列,其中Cys与L/D-Ser、L/D-Val和L/D-Tyr之间的连接均得到了单一异构体。然而,在L/D-Phe的C端发生的环化产生了不同程度的差向异构,但外消旋率均较低。以上结果表明NPC过程具有较高的关环效率,并且极少产生差向异构。 随后作者研究了Asp和Glu的C端羧酸根和侧链之间的选择性。他们制备了五种C端含有不同种类羧酸根的序列(4a-4e)(图3a)。从4a到4c,反应时间逐渐变长,环化产物的收率逐渐降低。当Asp位于C端时,4d的环化反应时间变得更长,转化率也较差,并且两种羧酸根之间没有明显的选择性,异构体的比例接近1:1。当Glu位于C端时,4e的环化反应主要生成α-羧酸根环化产物,而γ-羧酸根环化产物比例仅有5%。他们进一步研究了Asp和Glu分布于不同位置的多肽(8a-8g)的反应(图3b),发现含有Glu的多肽全部得到C端环化产物(9a-9d),含有Asp的多肽也主要在C端发生环化(9e-9f)。在同时含有Glu和Asp的多肽中,C端和Asp侧链酰胺化产物(9g和10g)的比例为1.7:1,而Glu侧链保持完整。以上结果总体表明,在NPC中C端α-羧酸根的亲核性比Asp和Glu侧链更强。 作者还进行了NPC的机理研究。他们对线性多肽Cys-Caprocid-Tyr-Phe进行不同的修饰,得到多肽类似物11和13。两种多肽都未能环化。其中不含羧酸根的11形成甲酰胺12(图4a),而13通过噁唑酮中间体13a得到差向异构体14(图4b)。根据以上结果,作者认为混合酸酐16中巯基和亚胺之间的分子内氢键使得硫解比噁唑酮形成更容易发生(图4c)。对于C端含有Asp残基时环化反应时间长和收率低的现象,作者认为可能原因是琥珀酸酐18的形成比硫解在动力学上更为有利(图4d)。 最后,作者通过NPC实现了多肽的原位转化(图4e)。环状CWNYA粗产物可以通过还原得到不含巯基的环肽20或通过S-烷基化得到苄基取代的环肽21,HPLC结果显示21具有较高的纯度(图4f)。此外,将NPC应用于线性多肽的混合物中,可以选择性地从相应的线性前体得到六种不同的环肽(图4g)。图4. NPC的可能机理、环肽的原位修饰和多肽的平行环化 综上所述,作者开发了一种NPC方法,实现了未修饰多肽的分子内连接,极大地简化了复杂的多肽连接过程。这种NPC方法对各种氨基酸残基具有很高的耐受性,有助于开发高效的基于环肽的治疗药物。DOI: 10.1021/jacs.3c10341Link: https://doi.org/10.1021/jacs.3c10341
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