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分享一篇发表在ACS Central Science上的文章:Development of a First-in-Class Small-Molecule Inhibitor of the C‑Terminal Hsp90 Dimerization,通讯作者是来自杜塞尔多夫大学的Thomas Kurz教授、Holger Gohlke教授和Sanil Bhatia教授,他们的研究方向分别是药物化学、计算生物学、白血病。
热休克蛋白90(Hsp90)是真核生物中重要的分子伴侣,具有调节蛋白折叠、稳定和成熟的作用。Hsp90在癌细胞中高表达,参与增殖以及抗凋亡作用,对癌症的恶性转化和发展至关重要,因此是癌症治疗潜在的靶点蛋白。
Hsp90是一种结构灵活的同源二聚体,其活性取决于ATP与N端结构域(NTD)结合和水解,以及C端结构域(CTD)的二聚化。中间结构域介导蛋白和辅因子的结合。目前研究的大多数Hsp90抑制剂是靶向NTD中ATP结合位点并具有泛抑制特性,其局限性在于眼部毒性、心脏毒性、脱靶效应、和热休克反应(heat shock response)。HSR会导致其他热休克蛋白(Hsp27、Hsp40和Hsp70)的表达,最终减弱抑制剂的作用。因为CTD抑制剂通常不会诱导HSR,于是作者希望通过靶向CTD二聚化界面来抑制Hsp90二聚体的形成,从而达到治疗效果。
基于计算预测和实验验证,作者首先确定了Hsp90 CTD二聚化界面中的热点残基是位于α-螺旋H5上的I688、Y689、I692和L696。作者选择了三嘧啶酮胺作为抑制剂骨架结构,因为这种骨架的侧链模式与Hsp90 CTD界面中热点残基的连续性一致,所以它可以作为潜在的α-螺旋模拟物。作者基于热点残基I688、I692和L696设计了化合物5a作为模拟物;基于Y689、I692和L696设计了化合物7a、7b;基于界面的疏水斑块设计了化合物5b,它侧链上4-甲氧基-苄基可作为螺旋H4'上S673'和T669'的(弱)氢键受体,但同时降低侧链的亲水性以便于更好地埋在疏水界面;引入更大的苄氧基衍生物5c和5d,它们也分别是7a和7b的前体。
随后作者对合成的抑制剂进行性能测试。通过大肠杆菌细胞表面展示Hsp90评价抑制剂对二聚体形成的抑制作用,通过微量热泳(microscale thermophoresis,MST)实验确定化合物与重组Hsp90 CTD的结合亲和力,并在白血病细胞系K562中测试体外细胞毒性。基于对二聚化的抑制、KD值和抗白血病活性,作者选择化合物5b进行下一步的实验,主要利用药物亲和反应的靶点稳定性(DARTS)、细胞热稳定分析(CETSA)、分子动力学模拟来证明5b与特异性靶标结合。最后,作者发现5b能干扰Hsp90 CTD二聚并破坏细胞内 Hsp90 多蛋白复合物,阻断 Hsp90 的伴侣功能。
综上,本文报道了第一个干扰Hsp90 CTD二聚化的低分子量化合物,对多种白血病细胞系和白血病细胞异种移植的斑马鱼模型具有活性,并且不会引发热休克反应。
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