【Nat. Chem. Biol.】全基因组筛选发现KDM2B参与蛋白质与硫酸乙酰肝素的结合

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on style="white-space: normal; text-indent: 2em;">硫酸乙酰肝素（HS）蛋白多糖结合胞外蛋白参与细胞信号传导、附着和内吞作用。这些相互作用依赖于硫酸化糖在HS链中的排列，HS链由具有良好特性的生物合成酶产生；然而，这些酶的调控在很大程度上是未知的。近期，美国加州大学圣地亚戈分校Jeffrey D. Esko组利用一个小分子配体结合HS进行了全基因组CRISPR-Cas9筛选。对A375黑色素瘤细胞的筛选发现了影响HS形成的额外的基因和途径。

图片来源：Nat. Chem. Biol.

 


通过筛选后发现，表观遗传因子KDM2B，一种组蛋白去甲基酶，它失活会抑制多种HS-硫转移酶并上调硫酸酯酶SULF1。这些变化对HS结合蛋白的相互作用有不同的影响。


图片来源：Nat. Chem. Biol.

 

KDM2B缺陷细胞的生长率下降，这是由SULF1失活挽救。此外，KDM2B缺失改变了许多细胞外基质基因的表达。因此，KDM2B通过调节HS结构控制A375细胞的增殖，并作为细胞外基质的主要调节因子。


图片来源：Nat. Chem. Biol.

 

参考文献：Genome-wide screens uncover KDM2B as a modifier of protein bindingto heparan sulfate

Nat. Chem. Biol.

DOI: 10.1038/s41589-021-00776-9

原文作者：Ryan J. Weiss, Philipp N. Spahn, Nathan E. Lewis✉ and Jeffrey D. Esko✉ et al.


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